干细胞治疗在改善自身免疫性肝病（如自身免疫性肝炎和原发性胆汁性肝硬化）中展现出一定的潜力，其主要原理基于以下几个方面：
1. 自我修复能力：干细胞具有分化为各种组织细胞的能力，包括肝细胞。当肝脏受损时，干细胞可以转化为新生的肝细胞，以补充和修复受损的肝组织。
2. 免疫调节：干细胞可以通过分泌多种细胞因子和生长因子，调节免疫系统，降低过度激活的免疫反应。它们能够抑制异常的T细胞和B细胞活动，减少针对自身肝细胞的攻击。
3. 遗传调控：干细胞可能通过改变自身的基因表达，减轻炎症反应和细胞凋亡，促进肝组织再生和稳定。
4. 细胞替代疗法：在某些情况下，直接移植来源丰富的干细胞（如肝脏间充质干细胞或造血干细胞）可能替换掉病变的细胞，恢复正常功能。
尽管干细胞疗法在动物模型和早期临床试验中显示了积极效果，但其应用仍处于研究阶段，需要进一步的临床试验来验证其安全性和有效性。
